Võ Minh Trọng bắt đầu tập bóng đá tại đội trẻ của Đồng Tháp ở tuổi 16.[1] Năm 2020, Minh Trọng cùng 9 cầu thủ khác của U-19 Đồng Tháp đã bị FIFA cấm thi đấu toàn cầu 6 tháng, từ 11 tháng 5 đến 10 tháng 11 năm 2020 do hành vi cá độ trong thời gian diễn ra vòng loại giải U-19 Quốc gia 2020.[2]

Năm 2022, Minh Trọng được cho đội hạng nhất Phú Thọ mượn. Tại đây, anh đã chơi 18 trên 22 trận trong mùa giải 2022.[3]